Дело в том, что с 2002 года в рамках сотрудничества с ФСБ компания Microsoft передает представителям спецслужбы исходные коды некоторых своих продуктов для экспертизы.
Skype скоро станет таким продуктом.

В мае 2011 года Microsoft приобрел компанию Skype за 8,5 милрд. долларов, но сделка еще не завершена, поэтому рано говорить о передаче каких-либо данных сервиса вообще. Но директор «Майкрософт Россия» Николай Прянишников не отрицает возможность открытия спецслужбам доступа к алгоритмам криптозащиты данных Skype.

Еще в апреле этого года ФСБ выступила с предложениям закрыть российским пользователям доступ к системе Skype, почтовым сервисам Gmail и Hotmail. Аргументом стала забота о национальной безопасности, так как представители службы не могут оперативно контролировать зашифрованные сообщения данных сервисов. Потом представители службы пояснили, что намерения закрыть сервисы нет.

Кстати, Россия стала первой страной, где правительство получило исходные коды операционных систем Windows 2000 и ХР.